Protein–RNA interactions for Protein: P53044

UFD1, Ubiquitin fusion degradation protein 1, yeastyeast

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UFD1P53044 SNT1YCR033W 3681 nt2.78□□□□□ -1.96
UFD1P53044 SRC1YML034W 2505 nt2.78□□□□□ -1.96
UFD1P53044 XRN1YGL173C 4587 nt2.78□□□□□ -1.96
UFD1P53044 RPS29BYDL061C 171 nt2.78□□□□□ -1.96
UFD1P53044 RRP17YDR412W 708 nt2.78□□□□□ -1.96
UFD1P53044 PAU10YDR542W 363 nt2.78□□□□□ -1.96
UFD1P53044 PAU11YGL261C 363 nt2.78□□□□□ -1.96
UFD1P53044 SCM4YGR049W 564 nt2.78□□□□□ -1.96
UFD1P53044 PAU13YHL046C 363 nt2.78□□□□□ -1.96
UFD1P53044 DCG1YIR030C 735 nt2.78□□□□□ -1.96
UFD1P53044 FIP1YJR093C 984 nt2.78□□□□□ -1.96
UFD1P53044 RIF2YLR453C 1188 nt2.78□□□□□ -1.96
UFD1P53044 PAU4YLR461W 363 nt2.78□□□□□ -1.96
UFD1P53044 YNL035CYNL035C 1170 nt2.78□□□□□ -1.96
UFD1P53044 YOL118CYOL118C 309 nt2.78□□□□□ -1.96
UFD1P53044 MRPL27YBR282W 441 nt2.78□□□□□ -1.96
UFD1P53044 DNM1YLL001W 2274 nt2.77□□□□□ -1.97
UFD1P53044 LIF1YGL090W 1266 nt2.77□□□□□ -1.97
UFD1P53044 ARC19YKL013C 516 nt2.77□□□□□ -1.97
UFD1P53044 YLR230WYLR230W 306 nt2.77□□□□□ -1.97
UFD1P53044 RPN13YLR421C 471 nt2.77□□□□□ -1.97
UFD1P53044 OCA2YNL056W 594 nt2.77□□□□□ -1.97
UFD1P53044 ATG5YPL149W 885 nt2.77□□□□□ -1.97
UFD1P53044 ATG29YPL166W 642 nt2.77□□□□□ -1.97
UFD1P53044 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.77□□□□□ -1.97
UFD1P53044 FRE2YKL220C 2136 nt2.77□□□□□ -1.97
UFD1P53044 TOP1YOL006C 2310 nt2.76□□□□□ -1.97
UFD1P53044 CHS2YBR038W 2892 nt2.76□□□□□ -1.97
UFD1P53044 YAT2YER024W 2772 nt2.76□□□□□ -1.97
UFD1P53044 TSC13YDL015C 933 nt2.76□□□□□ -1.97
UFD1P53044 YDR355CYDR355C 303 nt2.76□□□□□ -1.97
UFD1P53044 FRQ1YDR373W 573 nt2.76□□□□□ -1.97
UFD1P53044 RMT2YDR465C 1239 nt2.76□□□□□ -1.97
UFD1P53044 TLG1YDR468C 675 nt2.76□□□□□ -1.97
UFD1P53044 GTT1YIR038C 705 nt2.76□□□□□ -1.97
UFD1P53044 RSM26YJR101W 801 nt2.76□□□□□ -1.97
UFD1P53044 YMR310CYMR310C 954 nt2.76□□□□□ -1.97
UFD1P53044 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt2.76□□□□□ -1.97
UFD1P53044 TFB6YOR352W 1032 nt2.76□□□□□ -1.97
UFD1P53044 MRP2YPR166C 348 nt2.76□□□□□ -1.97
UFD1P53044 TFB2YPL122C 1542 nt2.76□□□□□ -1.97
UFD1P53044 RAX2YLR084C 3663 nt2.75□□□□□ -1.97
UFD1P53044 BMH2YDR099W 822 nt2.75□□□□□ -1.97
UFD1P53044 PRP18YGR006W 756 nt2.75□□□□□ -1.97
UFD1P53044 YHR022CYHR022C 771 nt2.75□□□□□ -1.97
UFD1P53044 DOG2YHR043C 741 nt2.75□□□□□ -1.97
UFD1P53044 MAK16YAL025C 921 nt2.75□□□□□ -1.97
UFD1P53044 ERP1YAR002C-A 660 nt2.75□□□□□ -1.97
UFD1P53044 DUG3YNL191W 1074 nt2.75□□□□□ -1.97
UFD1P53044 SYC1YOR179C 567 nt2.75□□□□□ -1.97
UFD1P53044 YJR061WYJR061W 2808 nt2.75□□□□□ -1.97
UFD1P53044 RSN1YMR266W 2862 nt2.75□□□□□ -1.97
UFD1P53044 PBI1YPL272C 1554 nt2.74□□□□□ -1.97
UFD1P53044 PCI8YIL071C 1335 nt2.74□□□□□ -1.97
UFD1P53044 RRP14YKL082C 1305 nt2.74□□□□□ -1.97
UFD1P53044 MON1YGL124C 1935 nt2.74□□□□□ -1.97
UFD1P53044 KXD1YGL079W 657 nt2.74□□□□□ -1.97
UFD1P53044 MRPL49YJL096W 486 nt2.74□□□□□ -1.97
UFD1P53044 HYM1YKL189W 1200 nt2.74□□□□□ -1.97
UFD1P53044 BUR2YLR226W 1188 nt2.74□□□□□ -1.97
UFD1P53044 YLR290CYLR290C 834 nt2.74□□□□□ -1.97
UFD1P53044 GLO1YML004C 981 nt2.74□□□□□ -1.97
UFD1P53044 YML090WYML090W 387 nt2.74□□□□□ -1.97
UFD1P53044 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt2.74□□□□□ -1.97
UFD1P53044 TRM112YNR046W 408 nt2.74□□□□□ -1.97
UFD1P53044 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt2.74□□□□□ -1.97
UFD1P53044 KRE2YDR483W 1329 nt2.73□□□□□ -1.97
UFD1P53044 YCR016WYCR016W 873 nt2.73□□□□□ -1.97
UFD1P53044 PMI40YER003C 1290 nt2.73□□□□□ -1.97
UFD1P53044 YFL051CYFL051C 483 nt2.73□□□□□ -1.97
UFD1P53044 RPS25AYGR027C 327 nt2.73□□□□□ -1.97
UFD1P53044 PTI1YGR156W 1278 nt2.73□□□□□ -1.97
UFD1P53044 ARG3YJL088W 1017 nt2.73□□□□□ -1.97
UFD1P53044 YJR128WYJR128W 360 nt2.73□□□□□ -1.97
UFD1P53044 HUB1YNR032C-A 222 nt2.73□□□□□ -1.97
UFD1P53044 YBR053CYBR053C 1077 nt2.73□□□□□ -1.97
UFD1P53044 NIP7YPL211W 546 nt2.73□□□□□ -1.97
UFD1P53044 YPR136CYPR136C 513 nt2.73□□□□□ -1.97
UFD1P53044 FUN30YAL019W 3396 nt2.73□□□□□ -1.97
UFD1P53044 TOM1YDR457W 9807 nt2.73□□□□□ -1.97
UFD1P53044 OPI6YDL096C 327 nt2.72□□□□□ -1.97
UFD1P53044 STP1YDR463W 1560 nt2.72□□□□□ -1.97
UFD1P53044 SPT15YER148W 723 nt2.72□□□□□ -1.97
UFD1P53044 YIL175WYIL175W 318 nt2.72□□□□□ -1.97
UFD1P53044 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt2.72□□□□□ -1.97
UFD1P53044 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt2.72□□□□□ -1.97
UFD1P53044 YJR056CYJR056C 711 nt2.72□□□□□ -1.97
UFD1P53044 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt2.72□□□□□ -1.97
UFD1P53044 VAM3YOR106W 852 nt2.72□□□□□ -1.97
UFD1P53044 HNT3YOR258W 654 nt2.72□□□□□ -1.97
UFD1P53044 PIN3YPR154W 648 nt2.72□□□□□ -1.97
UFD1P53044 CSH1YBR161W 1131 nt2.72□□□□□ -1.97
UFD1P53044 BNA4YBL098W 1383 nt2.72□□□□□ -1.97
UFD1P53044 DBP7YKR024C 2229 nt2.72□□□□□ -1.97
UFD1P53044 MOT1YPL082C 5604 nt2.71□□□□□ -1.98
UFD1P53044 SLI1YGR212W 1407 nt2.71□□□□□ -1.98
UFD1P53044 SNU23YDL098C 585 nt2.71□□□□□ -1.98
UFD1P53044 TGL2YDR058C 981 nt2.71□□□□□ -1.98
UFD1P53044 YDR340WYDR340W 303 nt2.71□□□□□ -1.98
UFD1P53044 YPR1YDR368W 939 nt2.71□□□□□ -1.98
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