Protein–RNA interactions for Protein: P51861

CDR1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR1P51861 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDR1P51861 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDR1P51861 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDR1P51861 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDR1P51861 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDR1P51861 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDR1P51861 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDR1P51861 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDR1P51861 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDR1P51861 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDR1P51861 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDR1P51861 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDR1P51861 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDR1P51861 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDR1P51861 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDR1P51861 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDR1P51861 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDR1P51861 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDR1P51861 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDR1P51861 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDR1P51861 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDR1P51861 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDR1P51861 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDR1P51861 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDR1P51861 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDR1P51861 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDR1P51861 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDR1P51861 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDR1P51861 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDR1P51861 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDR1P51861 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDR1P51861 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDR1P51861 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDR1P51861 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDR1P51861 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDR1P51861 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDR1P51861 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDR1P51861 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDR1P51861 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDR1P51861 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDR1P51861 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDR1P51861 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDR1P51861 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDR1P51861 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDR1P51861 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDR1P51861 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDR1P51861 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDR1P51861 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDR1P51861 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDR1P51861 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDR1P51861 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDR1P51861 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDR1P51861 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDR1P51861 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDR1P51861 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDR1P51861 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDR1P51861 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDR1P51861 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDR1P51861 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDR1P51861 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDR1P51861 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDR1P51861 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDR1P51861 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDR1P51861 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDR1P51861 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDR1P51861 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDR1P51861 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDR1P51861 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDR1P51861 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDR1P51861 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDR1P51861 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDR1P51861 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDR1P51861 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDR1P51861 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDR1P51861 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDR1P51861 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDR1P51861 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDR1P51861 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDR1P51861 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDR1P51861 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDR1P51861 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDR1P51861 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDR1P51861 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDR1P51861 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDR1P51861 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDR1P51861 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDR1P51861 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDR1P51861 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDR1P51861 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDR1P51861 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDR1P51861 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDR1P51861 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDR1P51861 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDR1P51861 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDR1P51861 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDR1P51861 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDR1P51861 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDR1P51861 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDR1P51861 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDR1P51861 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms