Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT8P50990 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT8P50990 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT8P50990 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT8P50990 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT8P50990 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT8P50990 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT8P50990 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT8P50990 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT8P50990 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT8P50990 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT8P50990 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT8P50990 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT8P50990 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT8P50990 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT8P50990 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT8P50990 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT8P50990 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT8P50990 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT8P50990 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCT8P50990 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCT8P50990 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCT8P50990 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCT8P50990 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCT8P50990 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCT8P50990 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCT8P50990 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCT8P50990 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCT8P50990 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCT8P50990 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCT8P50990 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCT8P50990 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCT8P50990 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCT8P50990 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCT8P50990 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCT8P50990 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCT8P50990 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCT8P50990 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCT8P50990 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCT8P50990 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCT8P50990 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCT8P50990 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCT8P50990 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCT8P50990 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCT8P50990 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCT8P50990 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCT8P50990 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCT8P50990 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCT8P50990 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCT8P50990 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCT8P50990 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCT8P50990 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCT8P50990 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCT8P50990 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCT8P50990 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCT8P50990 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCT8P50990 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCT8P50990 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCT8P50990 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCT8P50990 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCT8P50990 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCT8P50990 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCT8P50990 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCT8P50990 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCT8P50990 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCT8P50990 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCT8P50990 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCT8P50990 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCT8P50990 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCT8P50990 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCT8P50990 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCT8P50990 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCT8P50990 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCT8P50990 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCT8P50990 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCT8P50990 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCT8P50990 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCT8P50990 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCT8P50990 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCT8P50990 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCT8P50990 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCT8P50990 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCT8P50990 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCT8P50990 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCT8P50990 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCT8P50990 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCT8P50990 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCT8P50990 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCT8P50990 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCT8P50990 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCT8P50990 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCT8P50990 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCT8P50990 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCT8P50990 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCT8P50990 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCT8P50990 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCT8P50990 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCT8P50990 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCT8P50990 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCT8P50990 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms