Protein–RNA interactions for Protein: P50120

RBP2, Retinol-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP2P50120 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBP2P50120 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBP2P50120 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBP2P50120 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBP2P50120 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBP2P50120 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBP2P50120 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBP2P50120 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBP2P50120 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBP2P50120 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBP2P50120 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBP2P50120 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBP2P50120 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBP2P50120 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBP2P50120 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBP2P50120 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RBP2P50120 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RBP2P50120 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RBP2P50120 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBP2P50120 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBP2P50120 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBP2P50120 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBP2P50120 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBP2P50120 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RBP2P50120 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBP2P50120 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBP2P50120 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBP2P50120 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBP2P50120 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBP2P50120 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBP2P50120 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBP2P50120 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBP2P50120 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBP2P50120 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBP2P50120 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBP2P50120 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBP2P50120 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBP2P50120 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBP2P50120 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBP2P50120 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBP2P50120 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBP2P50120 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBP2P50120 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBP2P50120 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBP2P50120 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBP2P50120 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RBP2P50120 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBP2P50120 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBP2P50120 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBP2P50120 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBP2P50120 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBP2P50120 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBP2P50120 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBP2P50120 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBP2P50120 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBP2P50120 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBP2P50120 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBP2P50120 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBP2P50120 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBP2P50120 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBP2P50120 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBP2P50120 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RBP2P50120 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBP2P50120 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBP2P50120 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBP2P50120 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBP2P50120 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBP2P50120 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBP2P50120 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBP2P50120 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBP2P50120 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBP2P50120 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBP2P50120 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBP2P50120 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBP2P50120 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBP2P50120 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBP2P50120 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBP2P50120 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBP2P50120 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBP2P50120 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBP2P50120 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBP2P50120 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBP2P50120 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBP2P50120 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBP2P50120 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBP2P50120 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBP2P50120 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RBP2P50120 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBP2P50120 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBP2P50120 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBP2P50120 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBP2P50120 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBP2P50120 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RBP2P50120 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBP2P50120 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBP2P50120 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBP2P50120 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBP2P50120 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBP2P50120 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBP2P50120 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms