Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PSEN1P49768 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms