Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNTBP49356 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNTBP49356 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNTBP49356 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNTBP49356 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNTBP49356 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNTBP49356 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNTBP49356 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNTBP49356 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNTBP49356 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNTBP49356 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNTBP49356 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNTBP49356 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNTBP49356 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNTBP49356 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNTBP49356 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNTBP49356 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNTBP49356 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNTBP49356 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNTBP49356 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNTBP49356 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNTBP49356 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNTBP49356 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNTBP49356 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNTBP49356 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNTBP49356 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNTBP49356 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNTBP49356 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNTBP49356 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNTBP49356 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNTBP49356 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNTBP49356 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNTBP49356 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNTBP49356 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNTBP49356 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNTBP49356 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FNTBP49356 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNTBP49356 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNTBP49356 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNTBP49356 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNTBP49356 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNTBP49356 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNTBP49356 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNTBP49356 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FNTBP49356 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNTBP49356 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNTBP49356 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNTBP49356 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNTBP49356 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNTBP49356 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNTBP49356 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNTBP49356 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNTBP49356 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNTBP49356 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNTBP49356 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNTBP49356 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FNTBP49356 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNTBP49356 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNTBP49356 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNTBP49356 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FNTBP49356 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FNTBP49356 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FNTBP49356 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FNTBP49356 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNTBP49356 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNTBP49356 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNTBP49356 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNTBP49356 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNTBP49356 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNTBP49356 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNTBP49356 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNTBP49356 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNTBP49356 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNTBP49356 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNTBP49356 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FNTBP49356 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FNTBP49356 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FNTBP49356 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FNTBP49356 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNTBP49356 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FNTBP49356 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FNTBP49356 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FNTBP49356 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FNTBP49356 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FNTBP49356 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FNTBP49356 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FNTBP49356 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FNTBP49356 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FNTBP49356 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
FNTBP49356 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FNTBP49356 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FNTBP49356 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FNTBP49356 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FNTBP49356 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FNTBP49356 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FNTBP49356 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FNTBP49356 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FNTBP49356 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FNTBP49356 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FNTBP49356 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms