Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX1P48742 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX1P48742 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX1P48742 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX1P48742 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX1P48742 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX1P48742 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX1P48742 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX1P48742 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX1P48742 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX1P48742 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX1P48742 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX1P48742 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX1P48742 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX1P48742 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX1P48742 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX1P48742 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX1P48742 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX1P48742 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX1P48742 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX1P48742 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX1P48742 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX1P48742 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX1P48742 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX1P48742 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX1P48742 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX1P48742 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX1P48742 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX1P48742 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX1P48742 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX1P48742 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX1P48742 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX1P48742 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX1P48742 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX1P48742 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX1P48742 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX1P48742 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX1P48742 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX1P48742 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX1P48742 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX1P48742 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX1P48742 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX1P48742 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX1P48742 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX1P48742 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX1P48742 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX1P48742 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX1P48742 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX1P48742 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX1P48742 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX1P48742 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX1P48742 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LHX1P48742 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LHX1P48742 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LHX1P48742 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LHX1P48742 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LHX1P48742 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LHX1P48742 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LHX1P48742 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX1P48742 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX1P48742 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX1P48742 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX1P48742 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX1P48742 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX1P48742 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX1P48742 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX1P48742 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX1P48742 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX1P48742 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX1P48742 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX1P48742 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX1P48742 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX1P48742 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX1P48742 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX1P48742 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX1P48742 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX1P48742 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX1P48742 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX1P48742 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX1P48742 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX1P48742 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX1P48742 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX1P48742 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX1P48742 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX1P48742 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX1P48742 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX1P48742 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX1P48742 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX1P48742 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX1P48742 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX1P48742 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX1P48742 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX1P48742 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX1P48742 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX1P48742 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX1P48742 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX1P48742 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX1P48742 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX1P48742 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX1P48742 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms