Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
NESP48681 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
NESP48681 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.57
NESP48681 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC37.32■■■■□ 3.57
NESP48681 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
NESP48681 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.57
NESP48681 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
NESP48681 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
NESP48681 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
NESP48681 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
NESP48681 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
NESP48681 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
NESP48681 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
NESP48681 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
NESP48681 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
NESP48681 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
NESP48681 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
NESP48681 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
NESP48681 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
NESP48681 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
NESP48681 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
NESP48681 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
NESP48681 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
NESP48681 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
NESP48681 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
NESP48681 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
NESP48681 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
NESP48681 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
NESP48681 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
NESP48681 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
NESP48681 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC37.29■■■■□ 3.56
NESP48681 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NESP48681 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NESP48681 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC37.29■■■■□ 3.56
NESP48681 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NESP48681 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NESP48681 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
NESP48681 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
NESP48681 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
NESP48681 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
NESP48681 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
NESP48681 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
NESP48681 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
NESP48681 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
NESP48681 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
NESP48681 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
NESP48681 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
NESP48681 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
NESP48681 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
NESP48681 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
NESP48681 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
NESP48681 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
NESP48681 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
NESP48681 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
NESP48681 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
NESP48681 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
NESP48681 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
NESP48681 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
NESP48681 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
NESP48681 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
NESP48681 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
NESP48681 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
NESP48681 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
NESP48681 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
NESP48681 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC37.26■■■■□ 3.56
NESP48681 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
NESP48681 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
NESP48681 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
NESP48681 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
NESP48681 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
NESP48681 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
NESP48681 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
NESP48681 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
NESP48681 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
NESP48681 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
NESP48681 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
NESP48681 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
NESP48681 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
NESP48681 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
NESP48681 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NESP48681 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
NESP48681 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NESP48681 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NESP48681 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
NESP48681 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NESP48681 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
NESP48681 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
NESP48681 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
NESP48681 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
NESP48681 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
NESP48681 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NESP48681 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
NESP48681 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NESP48681 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
NESP48681 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
NESP48681 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NESP48681 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NESP48681 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NESP48681 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
NESP48681 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms