Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCT5P48643 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCT5P48643 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCT5P48643 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCT5P48643 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCT5P48643 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCT5P48643 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCT5P48643 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCT5P48643 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCT5P48643 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCT5P48643 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCT5P48643 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCT5P48643 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCT5P48643 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCT5P48643 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCT5P48643 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCT5P48643 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCT5P48643 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT5P48643 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT5P48643 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT5P48643 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT5P48643 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT5P48643 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT5P48643 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT5P48643 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT5P48643 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT5P48643 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT5P48643 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT5P48643 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT5P48643 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT5P48643 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT5P48643 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT5P48643 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT5P48643 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT5P48643 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT5P48643 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT5P48643 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT5P48643 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT5P48643 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCT5P48643 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCT5P48643 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCT5P48643 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCT5P48643 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCT5P48643 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCT5P48643 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCT5P48643 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCT5P48643 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCT5P48643 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCT5P48643 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCT5P48643 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCT5P48643 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCT5P48643 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCT5P48643 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCT5P48643 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCT5P48643 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCT5P48643 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCT5P48643 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCT5P48643 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCT5P48643 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCT5P48643 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCT5P48643 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCT5P48643 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCT5P48643 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCT5P48643 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCT5P48643 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCT5P48643 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCT5P48643 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCT5P48643 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCT5P48643 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCT5P48643 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCT5P48643 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCT5P48643 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCT5P48643 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCT5P48643 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCT5P48643 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCT5P48643 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCT5P48643 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCT5P48643 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCT5P48643 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCT5P48643 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCT5P48643 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCT5P48643 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCT5P48643 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCT5P48643 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCT5P48643 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCT5P48643 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCT5P48643 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCT5P48643 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCT5P48643 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCT5P48643 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCT5P48643 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCT5P48643 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCT5P48643 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCT5P48643 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCT5P48643 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCT5P48643 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCT5P48643 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCT5P48643 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCT5P48643 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCT5P48643 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms