Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NRIP1P48552 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms