Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGER3P43115 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms