Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC32.2■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
KDM5CP41229 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
KDM5CP41229 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms