Protein–RNA interactions for Protein: P40937

RFC5, Replication factor C subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC5P40937 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFC5P40937 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFC5P40937 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFC5P40937 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFC5P40937 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFC5P40937 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFC5P40937 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFC5P40937 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFC5P40937 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFC5P40937 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFC5P40937 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFC5P40937 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFC5P40937 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFC5P40937 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFC5P40937 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFC5P40937 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFC5P40937 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFC5P40937 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFC5P40937 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFC5P40937 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFC5P40937 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFC5P40937 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFC5P40937 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFC5P40937 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFC5P40937 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFC5P40937 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RFC5P40937 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFC5P40937 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFC5P40937 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFC5P40937 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFC5P40937 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFC5P40937 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFC5P40937 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RFC5P40937 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFC5P40937 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFC5P40937 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFC5P40937 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFC5P40937 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFC5P40937 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFC5P40937 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFC5P40937 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFC5P40937 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFC5P40937 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFC5P40937 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFC5P40937 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFC5P40937 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFC5P40937 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFC5P40937 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFC5P40937 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFC5P40937 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RFC5P40937 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFC5P40937 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFC5P40937 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFC5P40937 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFC5P40937 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFC5P40937 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFC5P40937 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFC5P40937 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFC5P40937 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFC5P40937 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RFC5P40937 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RFC5P40937 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFC5P40937 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFC5P40937 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFC5P40937 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFC5P40937 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFC5P40937 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFC5P40937 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFC5P40937 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFC5P40937 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFC5P40937 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFC5P40937 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFC5P40937 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFC5P40937 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFC5P40937 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFC5P40937 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFC5P40937 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFC5P40937 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFC5P40937 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFC5P40937 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFC5P40937 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFC5P40937 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFC5P40937 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFC5P40937 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFC5P40937 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFC5P40937 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFC5P40937 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFC5P40937 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFC5P40937 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFC5P40937 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFC5P40937 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFC5P40937 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFC5P40937 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFC5P40937 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFC5P40937 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFC5P40937 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RFC5P40937 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFC5P40937 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFC5P40937 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFC5P40937 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms