Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARL1P40616 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARL1P40616 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARL1P40616 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARL1P40616 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARL1P40616 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARL1P40616 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARL1P40616 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARL1P40616 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARL1P40616 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARL1P40616 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ARL1P40616 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARL1P40616 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ARL1P40616 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARL1P40616 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARL1P40616 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARL1P40616 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARL1P40616 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARL1P40616 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARL1P40616 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARL1P40616 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARL1P40616 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARL1P40616 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARL1P40616 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARL1P40616 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARL1P40616 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ARL1P40616 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARL1P40616 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARL1P40616 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARL1P40616 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARL1P40616 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARL1P40616 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARL1P40616 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARL1P40616 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARL1P40616 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ARL1P40616 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARL1P40616 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARL1P40616 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARL1P40616 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARL1P40616 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARL1P40616 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARL1P40616 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARL1P40616 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARL1P40616 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARL1P40616 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARL1P40616 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARL1P40616 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARL1P40616 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARL1P40616 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARL1P40616 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARL1P40616 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARL1P40616 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARL1P40616 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARL1P40616 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARL1P40616 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARL1P40616 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARL1P40616 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARL1P40616 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARL1P40616 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARL1P40616 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARL1P40616 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARL1P40616 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARL1P40616 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARL1P40616 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARL1P40616 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARL1P40616 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARL1P40616 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARL1P40616 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARL1P40616 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARL1P40616 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARL1P40616 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ARL1P40616 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARL1P40616 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARL1P40616 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARL1P40616 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARL1P40616 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARL1P40616 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARL1P40616 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARL1P40616 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARL1P40616 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ARL1P40616 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ARL1P40616 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ARL1P40616 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ARL1P40616 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ARL1P40616 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ARL1P40616 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARL1P40616 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARL1P40616 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARL1P40616 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARL1P40616 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ARL1P40616 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARL1P40616 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARL1P40616 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARL1P40616 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARL1P40616 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARL1P40616 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARL1P40616 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARL1P40616 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARL1P40616 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARL1P40616 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms