Protein–RNA interactions for Protein: P40516

EFM4, Protein-lysine N-methyltransferase EFM4, yeastyeast

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
EFM4P40516 MDM1YML104C 3384 nt3.4□□□□□ -1.86
EFM4P40516 SEC27YGL137W 2670 nt3.4□□□□□ -1.86
EFM4P40516 YIL161WYIL161W 708 nt3.4□□□□□ -1.87
EFM4P40516 ARG3YJL088W 1017 nt3.4□□□□□ -1.87
EFM4P40516 YAL034C-BYAL034C-B 354 nt3.4□□□□□ -1.87
EFM4P40516 AIM26YKL037W 357 nt3.4□□□□□ -1.87
EFM4P40516 SKG1YKR100C 1068 nt3.4□□□□□ -1.87
EFM4P40516 YNL013CYNL013C 378 nt3.4□□□□□ -1.87
EFM4P40516 NIP7YPL211W 546 nt3.4□□□□□ -1.87
EFM4P40516 NOP4YPL043W 2058 nt3.4□□□□□ -1.87
EFM4P40516 RRP5YMR229C 5190 nt3.4□□□□□ -1.87
EFM4P40516 HFM1YGL251C 3564 nt3.4□□□□□ -1.87
EFM4P40516 VPS9YML097C 1356 nt3.39□□□□□ -1.87
EFM4P40516 CHO2YGR157W 2610 nt3.39□□□□□ -1.87
EFM4P40516 RRP42YDL111C 798 nt3.39□□□□□ -1.87
EFM4P40516 PEX10YDR265W 1014 nt3.39□□□□□ -1.87
EFM4P40516 YEL075CYEL075C 369 nt3.39□□□□□ -1.87
EFM4P40516 LIF1YGL090W 1266 nt3.39□□□□□ -1.87
EFM4P40516 YGL214WYGL214W 486 nt3.39□□□□□ -1.87
EFM4P40516 RPS23AYGR118W 438 nt3.39□□□□□ -1.87
EFM4P40516 RPL13BYMR142C 600 nt3.39□□□□□ -1.87
EFM4P40516 YPR053CYPR053C 456 nt3.39□□□□□ -1.87
EFM4P40516 RPS23BYPR132W 438 nt3.39□□□□□ -1.87
EFM4P40516 RSF2YJR127C 4143 nt3.38□□□□□ -1.87
EFM4P40516 HEF3YNL014W 3135 nt3.38□□□□□ -1.87
EFM4P40516 YPS6YIR039C 1614 nt3.38□□□□□ -1.87
EFM4P40516 HTA1YDR225W 399 nt3.38□□□□□ -1.87
EFM4P40516 NKP1YDR383C 717 nt3.38□□□□□ -1.87
EFM4P40516 YGR114CYGR114C 390 nt3.38□□□□□ -1.87
EFM4P40516 YHR097CYHR097C 1101 nt3.38□□□□□ -1.87
EFM4P40516 POL30YBR088C 777 nt3.38□□□□□ -1.87
EFM4P40516 NDC80YIL144W 2076 nt3.38□□□□□ -1.87
EFM4P40516 SMC2YFR031C 3513 nt3.38□□□□□ -1.87
EFM4P40516 KIN3YAR018C 1308 nt3.38□□□□□ -1.87
EFM4P40516 SPH1YLR313C 1593 nt3.38□□□□□ -1.87
EFM4P40516 NMD2YHR077C 3270 nt3.38□□□□□ -1.87
EFM4P40516 SNU23YDL098C 585 nt3.37□□□□□ -1.87
EFM4P40516 MPS2YGL075C 1164 nt3.37□□□□□ -1.87
EFM4P40516 YGL152CYGL152C 678 nt3.37□□□□□ -1.87
EFM4P40516 YGR168CYGR168C 1131 nt3.37□□□□□ -1.87
EFM4P40516 TDA10YGR205W 873 nt3.37□□□□□ -1.87
EFM4P40516 MMF1YIL051C 438 nt3.37□□□□□ -1.87
EFM4P40516 YNR062CYNR062C 984 nt3.37□□□□□ -1.87
EFM4P40516 VAM10YOR068C 345 nt3.37□□□□□ -1.87
EFM4P40516 PHO88YBR106W 567 nt3.37□□□□□ -1.87
EFM4P40516 ERV15YBR210W 429 nt3.37□□□□□ -1.87
EFM4P40516 RPO21YDL140C 5202 nt3.37□□□□□ -1.87
EFM4P40516 VPS33YLR396C 2076 nt3.37□□□□□ -1.87
EFM4P40516 VBA4YDR119W 2307 nt3.37□□□□□ -1.87
EFM4P40516 GCN1YGL195W 8019 nt3.37□□□□□ -1.87
EFM4P40516 CIN1YOR349W 3045 nt3.36□□□□□ -1.87
EFM4P40516 PLP1YDR183W 693 nt3.36□□□□□ -1.87
EFM4P40516 FMP32YFL046W 624 nt3.36□□□□□ -1.87
EFM4P40516 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt3.36□□□□□ -1.87
EFM4P40516 MRP8YKL142W 660 nt3.36□□□□□ -1.87
EFM4P40516 COQ9YLR201C 783 nt3.36□□□□□ -1.87
EFM4P40516 PML39YML107C 1005 nt3.36□□□□□ -1.87
EFM4P40516 YNL184CYNL184C 327 nt3.36□□□□□ -1.87
EFM4P40516 CCL1YPR025C 1182 nt3.36□□□□□ -1.87
EFM4P40516 PSY4YBL046W 1326 nt3.36□□□□□ -1.87
EFM4P40516 JJJ1YNL227C 1773 nt3.35□□□□□ -1.87
EFM4P40516 PEX1YKL197C 3132 nt3.35□□□□□ -1.87
EFM4P40516 ARF1YDL192W 546 nt3.35□□□□□ -1.87
EFM4P40516 YDR535CYDR535C 501 nt3.35□□□□□ -1.87
EFM4P40516 YGR039WYGR039W 312 nt3.35□□□□□ -1.87
EFM4P40516 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt3.35□□□□□ -1.87
EFM4P40516 YML090WYML090W 387 nt3.35□□□□□ -1.87
EFM4P40516 YBL028CYBL028C 321 nt3.35□□□□□ -1.87
EFM4P40516 PNO1YOR145C 825 nt3.35□□□□□ -1.87
EFM4P40516 RPA43YOR340C 981 nt3.35□□□□□ -1.87
EFM4P40516 YDR131CYDR131C 1671 nt3.35□□□□□ -1.87
EFM4P40516 MSH2YOL090W 2895 nt3.34□□□□□ -1.87
EFM4P40516 BI3Q0115 1554 nt3.34□□□□□ -1.87
EFM4P40516 CDC5YMR001C 2118 nt3.34□□□□□ -1.87
EFM4P40516 AKR1YDR264C 2295 nt3.34□□□□□ -1.87
EFM4P40516 BSC1YDL037C 987 nt3.34□□□□□ -1.87
EFM4P40516 RGI1YER067W 486 nt3.34□□□□□ -1.87
EFM4P40516 CDC26YFR036W 375 nt3.34□□□□□ -1.87
EFM4P40516 BET5YML077W 480 nt3.34□□□□□ -1.87
EFM4P40516 CDC40YDR364C 1368 nt3.34□□□□□ -1.88
EFM4P40516 TEC1YBR083W 1461 nt3.34□□□□□ -1.88
EFM4P40516 PDR12YPL058C 4536 nt3.34□□□□□ -1.88
EFM4P40516 MYO5YMR109W 3660 nt3.33□□□□□ -1.88
EFM4P40516 OPI6YDL096C 327 nt3.33□□□□□ -1.88
EFM4P40516 MEI4YER044C-A 1227 nt3.33□□□□□ -1.88
EFM4P40516 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt3.33□□□□□ -1.88
EFM4P40516 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt3.33□□□□□ -1.88
EFM4P40516 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt3.33□□□□□ -1.88
EFM4P40516 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt3.33□□□□□ -1.88
EFM4P40516 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt3.33□□□□□ -1.88
EFM4P40516 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt3.33□□□□□ -1.88
EFM4P40516 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt3.33□□□□□ -1.88
EFM4P40516 SUP56tL(CAA)A 82 nt3.33□□□□□ -1.88
EFM4P40516 SUP53tL(CAA)C 82 nt3.33□□□□□ -1.88
EFM4P40516 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt3.33□□□□□ -1.88
EFM4P40516 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt3.33□□□□□ -1.88
EFM4P40516 SUP54tL(CAA)G2 82 nt3.33□□□□□ -1.88
EFM4P40516 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt3.33□□□□□ -1.88
EFM4P40516 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt3.33□□□□□ -1.88
EFM4P40516 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21 ms