Protein–RNA interactions for Protein: P39748

FEN1, Flap endonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FEN1P39748 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FEN1P39748 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FEN1P39748 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FEN1P39748 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FEN1P39748 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FEN1P39748 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FEN1P39748 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FEN1P39748 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FEN1P39748 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FEN1P39748 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FEN1P39748 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FEN1P39748 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FEN1P39748 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FEN1P39748 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FEN1P39748 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FEN1P39748 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
FEN1P39748 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FEN1P39748 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FEN1P39748 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FEN1P39748 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FEN1P39748 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FEN1P39748 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FEN1P39748 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FEN1P39748 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FEN1P39748 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FEN1P39748 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FEN1P39748 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FEN1P39748 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FEN1P39748 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FEN1P39748 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FEN1P39748 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FEN1P39748 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FEN1P39748 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FEN1P39748 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FEN1P39748 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FEN1P39748 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FEN1P39748 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FEN1P39748 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FEN1P39748 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FEN1P39748 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FEN1P39748 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FEN1P39748 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FEN1P39748 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FEN1P39748 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FEN1P39748 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FEN1P39748 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FEN1P39748 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FEN1P39748 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FEN1P39748 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FEN1P39748 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FEN1P39748 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FEN1P39748 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FEN1P39748 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FEN1P39748 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FEN1P39748 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FEN1P39748 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FEN1P39748 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FEN1P39748 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FEN1P39748 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FEN1P39748 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FEN1P39748 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FEN1P39748 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FEN1P39748 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FEN1P39748 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FEN1P39748 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FEN1P39748 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FEN1P39748 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FEN1P39748 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FEN1P39748 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FEN1P39748 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FEN1P39748 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FEN1P39748 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FEN1P39748 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FEN1P39748 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FEN1P39748 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FEN1P39748 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FEN1P39748 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FEN1P39748 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FEN1P39748 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FEN1P39748 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FEN1P39748 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FEN1P39748 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FEN1P39748 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FEN1P39748 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FEN1P39748 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FEN1P39748 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FEN1P39748 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FEN1P39748 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FEN1P39748 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FEN1P39748 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FEN1P39748 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FEN1P39748 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FEN1P39748 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FEN1P39748 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FEN1P39748 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FEN1P39748 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FEN1P39748 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FEN1P39748 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FEN1P39748 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FEN1P39748 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms