Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPARGP37231 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPARGP37231 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPARGP37231 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPARGP37231 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPARGP37231 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPARGP37231 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPARGP37231 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPARGP37231 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPARGP37231 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPARGP37231 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PPARGP37231 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PPARGP37231 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPARGP37231 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPARGP37231 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPARGP37231 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPARGP37231 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPARGP37231 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPARGP37231 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPARGP37231 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPARGP37231 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPARGP37231 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPARGP37231 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPARGP37231 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPARGP37231 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPARGP37231 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPARGP37231 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPARGP37231 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPARGP37231 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPARGP37231 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PPARGP37231 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPARGP37231 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PPARGP37231 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPARGP37231 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPARGP37231 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPARGP37231 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPARGP37231 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPARGP37231 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPARGP37231 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPARGP37231 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PPARGP37231 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPARGP37231 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPARGP37231 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPARGP37231 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPARGP37231 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPARGP37231 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPARGP37231 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPARGP37231 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPARGP37231 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPARGP37231 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPARGP37231 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PPARGP37231 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPARGP37231 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPARGP37231 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PPARGP37231 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PPARGP37231 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPARGP37231 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPARGP37231 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPARGP37231 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPARGP37231 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PPARGP37231 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPARGP37231 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPARGP37231 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPARGP37231 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PPARGP37231 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPARGP37231 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PPARGP37231 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PPARGP37231 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPARGP37231 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPARGP37231 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PPARGP37231 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPARGP37231 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPARGP37231 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PPARGP37231 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PPARGP37231 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PPARGP37231 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPARGP37231 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPARGP37231 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPARGP37231 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPARGP37231 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PPARGP37231 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPARGP37231 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PPARGP37231 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PPARGP37231 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPARGP37231 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPARGP37231 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPARGP37231 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPARGP37231 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PPARGP37231 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPARGP37231 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PPARGP37231 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPARGP37231 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPARGP37231 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPARGP37231 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPARGP37231 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PPARGP37231 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPARGP37231 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PPARGP37231 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPARGP37231 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PPARGP37231 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms