Protein–RNA interactions for Protein: P35790

CHKA, Choline kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKAP35790 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHKAP35790 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHKAP35790 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHKAP35790 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHKAP35790 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHKAP35790 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHKAP35790 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHKAP35790 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHKAP35790 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHKAP35790 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHKAP35790 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHKAP35790 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHKAP35790 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHKAP35790 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHKAP35790 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHKAP35790 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHKAP35790 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHKAP35790 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHKAP35790 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHKAP35790 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHKAP35790 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHKAP35790 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHKAP35790 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHKAP35790 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHKAP35790 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHKAP35790 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHKAP35790 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHKAP35790 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHKAP35790 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHKAP35790 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHKAP35790 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHKAP35790 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHKAP35790 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHKAP35790 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHKAP35790 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHKAP35790 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHKAP35790 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHKAP35790 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHKAP35790 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHKAP35790 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHKAP35790 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHKAP35790 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHKAP35790 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHKAP35790 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHKAP35790 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHKAP35790 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHKAP35790 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHKAP35790 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHKAP35790 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHKAP35790 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHKAP35790 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHKAP35790 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHKAP35790 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHKAP35790 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHKAP35790 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHKAP35790 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHKAP35790 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHKAP35790 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHKAP35790 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHKAP35790 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHKAP35790 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHKAP35790 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHKAP35790 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHKAP35790 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHKAP35790 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHKAP35790 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHKAP35790 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHKAP35790 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHKAP35790 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHKAP35790 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHKAP35790 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHKAP35790 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHKAP35790 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHKAP35790 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHKAP35790 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHKAP35790 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHKAP35790 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHKAP35790 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHKAP35790 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHKAP35790 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHKAP35790 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHKAP35790 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHKAP35790 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHKAP35790 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHKAP35790 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHKAP35790 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHKAP35790 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHKAP35790 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHKAP35790 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHKAP35790 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHKAP35790 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHKAP35790 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHKAP35790 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHKAP35790 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHKAP35790 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHKAP35790 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHKAP35790 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHKAP35790 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHKAP35790 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHKAP35790 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms