Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP1P32455 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP1P32455 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP1P32455 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP1P32455 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP1P32455 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP1P32455 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP1P32455 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP1P32455 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP1P32455 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP1P32455 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP1P32455 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP1P32455 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP1P32455 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP1P32455 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP1P32455 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP1P32455 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP1P32455 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP1P32455 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP1P32455 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP1P32455 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP1P32455 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP1P32455 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP1P32455 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP1P32455 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP1P32455 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GBP1P32455 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GBP1P32455 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GBP1P32455 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBP1P32455 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBP1P32455 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBP1P32455 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBP1P32455 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBP1P32455 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBP1P32455 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBP1P32455 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBP1P32455 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GBP1P32455 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBP1P32455 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBP1P32455 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP1P32455 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP1P32455 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP1P32455 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP1P32455 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP1P32455 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP1P32455 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP1P32455 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP1P32455 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP1P32455 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP1P32455 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP1P32455 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP1P32455 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP1P32455 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP1P32455 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP1P32455 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP1P32455 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP1P32455 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP1P32455 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP1P32455 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP1P32455 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP1P32455 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP1P32455 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP1P32455 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP1P32455 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP1P32455 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP1P32455 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP1P32455 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP1P32455 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP1P32455 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP1P32455 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP1P32455 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP1P32455 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP1P32455 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP1P32455 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP1P32455 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP1P32455 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP1P32455 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP1P32455 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP1P32455 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP1P32455 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP1P32455 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP1P32455 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP1P32455 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP1P32455 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP1P32455 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP1P32455 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP1P32455 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP1P32455 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP1P32455 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP1P32455 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP1P32455 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP1P32455 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP1P32455 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP1P32455 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP1P32455 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP1P32455 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP1P32455 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP1P32455 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP1P32455 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP1P32455 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms