Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 AL391863.1-201ENST00000422776 743 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 AC131649.1-201ENST00000569215 1313 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 AL645634.1-201ENST00000418426 462 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 TYW3-205ENST00000479111 1130 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 PLSCR2-205ENST00000497985 1441 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 TTC32-201ENST00000333610 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 AL133417.1-201ENST00000425290 688 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 AC018362.1-201ENST00000564805 846 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 AC007228.2-201ENST00000602145 1328 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 AL023284.3-202ENST00000571188 543 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD11P31277 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 AC114495.2-201ENST00000452686 437 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms