Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.5 ms