Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CLIP1P30622 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CLIP1P30622 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms