Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTGFP29279 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTGFP29279 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTGFP29279 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTGFP29279 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTGFP29279 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CTGFP29279 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTGFP29279 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTGFP29279 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTGFP29279 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTGFP29279 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTGFP29279 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTGFP29279 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTGFP29279 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTGFP29279 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CTGFP29279 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTGFP29279 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTGFP29279 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CTGFP29279 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTGFP29279 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTGFP29279 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTGFP29279 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTGFP29279 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTGFP29279 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTGFP29279 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTGFP29279 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTGFP29279 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTGFP29279 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTGFP29279 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTGFP29279 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTGFP29279 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTGFP29279 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CTGFP29279 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTGFP29279 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTGFP29279 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTGFP29279 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTGFP29279 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTGFP29279 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTGFP29279 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTGFP29279 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTGFP29279 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTGFP29279 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTGFP29279 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTGFP29279 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTGFP29279 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTGFP29279 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTGFP29279 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTGFP29279 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CTGFP29279 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTGFP29279 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTGFP29279 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTGFP29279 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTGFP29279 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTGFP29279 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTGFP29279 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTGFP29279 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTGFP29279 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTGFP29279 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTGFP29279 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTGFP29279 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTGFP29279 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTGFP29279 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTGFP29279 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CTGFP29279 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTGFP29279 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CTGFP29279 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CTGFP29279 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTGFP29279 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTGFP29279 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTGFP29279 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTGFP29279 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTGFP29279 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTGFP29279 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTGFP29279 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTGFP29279 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTGFP29279 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTGFP29279 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTGFP29279 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTGFP29279 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTGFP29279 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTGFP29279 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTGFP29279 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTGFP29279 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTGFP29279 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTGFP29279 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTGFP29279 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTGFP29279 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTGFP29279 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTGFP29279 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTGFP29279 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTGFP29279 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTGFP29279 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTGFP29279 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTGFP29279 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CTGFP29279 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTGFP29279 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTGFP29279 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTGFP29279 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTGFP29279 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTGFP29279 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms