Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK1P29120 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCSK1P29120 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms