Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBL1P28749 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBL1P28749 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBL1P28749 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBL1P28749 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBL1P28749 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBL1P28749 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBL1P28749 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBL1P28749 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBL1P28749 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBL1P28749 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBL1P28749 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBL1P28749 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RBL1P28749 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RBL1P28749 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RBL1P28749 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RBL1P28749 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RBL1P28749 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RBL1P28749 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBL1P28749 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBL1P28749 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBL1P28749 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBL1P28749 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RBL1P28749 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBL1P28749 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBL1P28749 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBL1P28749 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBL1P28749 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBL1P28749 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBL1P28749 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBL1P28749 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBL1P28749 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBL1P28749 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBL1P28749 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBL1P28749 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBL1P28749 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBL1P28749 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBL1P28749 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBL1P28749 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBL1P28749 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBL1P28749 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBL1P28749 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBL1P28749 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBL1P28749 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBL1P28749 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBL1P28749 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBL1P28749 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBL1P28749 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBL1P28749 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBL1P28749 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBL1P28749 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RBL1P28749 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBL1P28749 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBL1P28749 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBL1P28749 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBL1P28749 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBL1P28749 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBL1P28749 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RBL1P28749 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RBL1P28749 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBL1P28749 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBL1P28749 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBL1P28749 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBL1P28749 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBL1P28749 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBL1P28749 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBL1P28749 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBL1P28749 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBL1P28749 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBL1P28749 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBL1P28749 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBL1P28749 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBL1P28749 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBL1P28749 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBL1P28749 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RBL1P28749 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBL1P28749 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBL1P28749 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBL1P28749 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBL1P28749 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBL1P28749 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBL1P28749 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBL1P28749 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBL1P28749 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBL1P28749 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBL1P28749 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RBL1P28749 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBL1P28749 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBL1P28749 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBL1P28749 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBL1P28749 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBL1P28749 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBL1P28749 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBL1P28749 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBL1P28749 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBL1P28749 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBL1P28749 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBL1P28749 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBL1P28749 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBL1P28749 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms