Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
YY1P25490 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
YY1P25490 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
YY1P25490 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
YY1P25490 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
YY1P25490 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
YY1P25490 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
YY1P25490 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
YY1P25490 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
YY1P25490 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
YY1P25490 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
YY1P25490 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
YY1P25490 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
YY1P25490 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
YY1P25490 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
YY1P25490 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
YY1P25490 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
YY1P25490 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
YY1P25490 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
YY1P25490 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
YY1P25490 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
YY1P25490 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
YY1P25490 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
YY1P25490 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
YY1P25490 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
YY1P25490 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
YY1P25490 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
YY1P25490 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
YY1P25490 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
YY1P25490 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
YY1P25490 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
YY1P25490 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
YY1P25490 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
YY1P25490 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
YY1P25490 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
YY1P25490 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
YY1P25490 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
YY1P25490 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
YY1P25490 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
YY1P25490 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
YY1P25490 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
YY1P25490 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
YY1P25490 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
YY1P25490 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
YY1P25490 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
YY1P25490 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
YY1P25490 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
YY1P25490 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
YY1P25490 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
YY1P25490 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
YY1P25490 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
YY1P25490 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
YY1P25490 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
YY1P25490 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
YY1P25490 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
YY1P25490 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
YY1P25490 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
YY1P25490 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
YY1P25490 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
YY1P25490 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
YY1P25490 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
YY1P25490 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
YY1P25490 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
YY1P25490 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
YY1P25490 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
YY1P25490 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
YY1P25490 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
YY1P25490 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
YY1P25490 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
YY1P25490 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
YY1P25490 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
YY1P25490 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
YY1P25490 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
YY1P25490 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
YY1P25490 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
YY1P25490 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
YY1P25490 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
YY1P25490 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
YY1P25490 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
YY1P25490 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
YY1P25490 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
YY1P25490 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
YY1P25490 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
YY1P25490 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
YY1P25490 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
YY1P25490 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
YY1P25490 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
YY1P25490 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
YY1P25490 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
YY1P25490 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
YY1P25490 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
YY1P25490 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
YY1P25490 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
YY1P25490 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
YY1P25490 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
YY1P25490 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
YY1P25490 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
YY1P25490 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
YY1P25490 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
YY1P25490 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms