Protein–RNA interactions for Protein: P23921

RRM1, Ribonucleoside-diphosphate reductase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM1P23921 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRM1P23921 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRM1P23921 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRM1P23921 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRM1P23921 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRM1P23921 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRM1P23921 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRM1P23921 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRM1P23921 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRM1P23921 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRM1P23921 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRM1P23921 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRM1P23921 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRM1P23921 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRM1P23921 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RRM1P23921 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRM1P23921 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRM1P23921 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RRM1P23921 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRM1P23921 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRM1P23921 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRM1P23921 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRM1P23921 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRM1P23921 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRM1P23921 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRM1P23921 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRM1P23921 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRM1P23921 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRM1P23921 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRM1P23921 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRM1P23921 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRM1P23921 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRM1P23921 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRM1P23921 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRM1P23921 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRM1P23921 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRM1P23921 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRM1P23921 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRM1P23921 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRM1P23921 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RRM1P23921 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRM1P23921 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRM1P23921 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRM1P23921 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRM1P23921 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRM1P23921 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRM1P23921 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRM1P23921 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRM1P23921 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRM1P23921 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRM1P23921 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRM1P23921 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRM1P23921 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRM1P23921 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRM1P23921 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRM1P23921 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRM1P23921 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRM1P23921 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RRM1P23921 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRM1P23921 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRM1P23921 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRM1P23921 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RRM1P23921 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRM1P23921 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRM1P23921 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRM1P23921 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRM1P23921 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRM1P23921 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRM1P23921 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RRM1P23921 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRM1P23921 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRM1P23921 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRM1P23921 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRM1P23921 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRM1P23921 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRM1P23921 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRM1P23921 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRM1P23921 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRM1P23921 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRM1P23921 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRM1P23921 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRM1P23921 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRM1P23921 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRM1P23921 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRM1P23921 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRM1P23921 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRM1P23921 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRM1P23921 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRM1P23921 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRM1P23921 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRM1P23921 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRM1P23921 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRM1P23921 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRM1P23921 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRM1P23921 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRM1P23921 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRM1P23921 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRM1P23921 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRM1P23921 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRM1P23921 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms