Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGFR4P22455 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms