Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR1D1P20393 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR1D1P20393 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms