Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms