Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRAP18433 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
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