Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD44P16070 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD44P16070 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD44P16070 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD44P16070 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD44P16070 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD44P16070 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD44P16070 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD44P16070 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD44P16070 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD44P16070 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD44P16070 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD44P16070 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD44P16070 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD44P16070 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD44P16070 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD44P16070 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD44P16070 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD44P16070 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD44P16070 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD44P16070 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD44P16070 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD44P16070 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD44P16070 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD44P16070 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD44P16070 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD44P16070 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CD44P16070 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD44P16070 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD44P16070 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD44P16070 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD44P16070 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD44P16070 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD44P16070 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD44P16070 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD44P16070 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD44P16070 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD44P16070 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD44P16070 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD44P16070 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD44P16070 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD44P16070 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD44P16070 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD44P16070 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD44P16070 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD44P16070 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD44P16070 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD44P16070 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD44P16070 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD44P16070 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD44P16070 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD44P16070 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD44P16070 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD44P16070 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD44P16070 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD44P16070 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD44P16070 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD44P16070 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD44P16070 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD44P16070 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD44P16070 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD44P16070 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD44P16070 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD44P16070 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD44P16070 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD44P16070 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD44P16070 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CD44P16070 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD44P16070 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD44P16070 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD44P16070 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD44P16070 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD44P16070 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD44P16070 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD44P16070 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD44P16070 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD44P16070 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD44P16070 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD44P16070 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD44P16070 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD44P16070 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD44P16070 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD44P16070 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD44P16070 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD44P16070 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD44P16070 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD44P16070 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD44P16070 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD44P16070 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD44P16070 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD44P16070 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD44P16070 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD44P16070 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD44P16070 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CD44P16070 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD44P16070 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD44P16070 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD44P16070 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD44P16070 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD44P16070 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms