Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCG2P13521 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCG2P13521 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCG2P13521 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCG2P13521 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCG2P13521 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCG2P13521 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCG2P13521 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCG2P13521 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCG2P13521 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCG2P13521 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCG2P13521 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCG2P13521 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCG2P13521 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCG2P13521 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCG2P13521 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCG2P13521 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCG2P13521 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCG2P13521 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCG2P13521 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCG2P13521 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCG2P13521 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCG2P13521 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCG2P13521 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCG2P13521 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCG2P13521 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCG2P13521 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCG2P13521 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCG2P13521 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCG2P13521 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCG2P13521 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCG2P13521 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCG2P13521 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCG2P13521 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCG2P13521 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCG2P13521 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCG2P13521 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCG2P13521 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCG2P13521 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCG2P13521 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCG2P13521 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCG2P13521 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCG2P13521 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCG2P13521 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCG2P13521 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCG2P13521 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCG2P13521 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCG2P13521 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCG2P13521 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCG2P13521 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCG2P13521 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCG2P13521 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCG2P13521 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCG2P13521 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCG2P13521 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SCG2P13521 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCG2P13521 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCG2P13521 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCG2P13521 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SCG2P13521 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCG2P13521 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCG2P13521 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCG2P13521 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCG2P13521 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCG2P13521 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCG2P13521 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCG2P13521 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCG2P13521 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCG2P13521 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCG2P13521 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCG2P13521 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCG2P13521 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCG2P13521 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCG2P13521 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCG2P13521 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCG2P13521 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCG2P13521 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCG2P13521 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCG2P13521 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCG2P13521 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCG2P13521 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCG2P13521 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCG2P13521 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCG2P13521 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCG2P13521 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCG2P13521 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCG2P13521 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCG2P13521 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCG2P13521 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCG2P13521 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCG2P13521 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCG2P13521 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCG2P13521 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCG2P13521 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCG2P13521 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCG2P13521 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCG2P13521 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCG2P13521 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCG2P13521 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCG2P13521 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms