Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN1P12814 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms