Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PYGBP11216 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PYGBP11216 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PYGBP11216 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PYGBP11216 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PYGBP11216 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PYGBP11216 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PYGBP11216 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PYGBP11216 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PYGBP11216 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PYGBP11216 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PYGBP11216 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PYGBP11216 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PYGBP11216 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PYGBP11216 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PYGBP11216 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PYGBP11216 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PYGBP11216 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PYGBP11216 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PYGBP11216 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PYGBP11216 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PYGBP11216 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PYGBP11216 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PYGBP11216 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PYGBP11216 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PYGBP11216 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PYGBP11216 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PYGBP11216 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PYGBP11216 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PYGBP11216 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PYGBP11216 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PYGBP11216 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PYGBP11216 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PYGBP11216 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PYGBP11216 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PYGBP11216 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PYGBP11216 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PYGBP11216 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PYGBP11216 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PYGBP11216 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PYGBP11216 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PYGBP11216 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PYGBP11216 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PYGBP11216 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PYGBP11216 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
PYGBP11216 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PYGBP11216 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PYGBP11216 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PYGBP11216 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PYGBP11216 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PYGBP11216 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PYGBP11216 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PYGBP11216 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PYGBP11216 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PYGBP11216 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PYGBP11216 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PYGBP11216 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PYGBP11216 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PYGBP11216 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PYGBP11216 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PYGBP11216 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PYGBP11216 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PYGBP11216 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PYGBP11216 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PYGBP11216 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PYGBP11216 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PYGBP11216 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PYGBP11216 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PYGBP11216 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PYGBP11216 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PYGBP11216 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PYGBP11216 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PYGBP11216 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PYGBP11216 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PYGBP11216 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PYGBP11216 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PYGBP11216 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PYGBP11216 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PYGBP11216 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PYGBP11216 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PYGBP11216 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PYGBP11216 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PYGBP11216 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PYGBP11216 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PYGBP11216 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PYGBP11216 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PYGBP11216 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PYGBP11216 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PYGBP11216 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PYGBP11216 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PYGBP11216 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PYGBP11216 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PYGBP11216 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PYGBP11216 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PYGBP11216 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PYGBP11216 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PYGBP11216 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PYGBP11216 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PYGBP11216 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PYGBP11216 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.1 ms