Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW4

SMIM10L2A, Small integral membrane protein 10-like protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2AP0DMW4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM10L2AP0DMW4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms