Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC172P0C7W6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC172P0C7W6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms