Protein–RNA interactions for Protein: P08729

KRT7, Keratin, type II cytoskeletal 7, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT7P08729 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT7P08729 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT7P08729 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT7P08729 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT7P08729 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT7P08729 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT7P08729 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT7P08729 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT7P08729 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT7P08729 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT7P08729 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT7P08729 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT7P08729 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT7P08729 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT7P08729 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT7P08729 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT7P08729 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT7P08729 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT7P08729 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT7P08729 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT7P08729 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT7P08729 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT7P08729 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT7P08729 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT7P08729 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT7P08729 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT7P08729 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT7P08729 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT7P08729 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT7P08729 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT7P08729 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT7P08729 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT7P08729 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT7P08729 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT7P08729 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT7P08729 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT7P08729 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT7P08729 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT7P08729 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT7P08729 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT7P08729 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT7P08729 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT7P08729 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT7P08729 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT7P08729 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT7P08729 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT7P08729 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT7P08729 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT7P08729 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT7P08729 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT7P08729 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT7P08729 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT7P08729 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT7P08729 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT7P08729 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT7P08729 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT7P08729 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT7P08729 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT7P08729 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT7P08729 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT7P08729 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT7P08729 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT7P08729 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT7P08729 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT7P08729 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT7P08729 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT7P08729 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT7P08729 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT7P08729 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT7P08729 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT7P08729 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT7P08729 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT7P08729 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT7P08729 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT7P08729 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT7P08729 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT7P08729 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT7P08729 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT7P08729 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT7P08729 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT7P08729 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT7P08729 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT7P08729 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT7P08729 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT7P08729 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT7P08729 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT7P08729 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT7P08729 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT7P08729 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT7P08729 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT7P08729 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT7P08729 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT7P08729 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT7P08729 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT7P08729 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT7P08729 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT7P08729 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT7P08729 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT7P08729 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT7P08729 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms