Protein–RNA interactions for Protein: P01903

HLA-DRA, HLA class II histocompatibility antigen, DR alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRAP01903 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HLA-DRAP01903 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DRAP01903 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms