Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
APBA3O96018 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
APBA3O96018 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
APBA3O96018 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
APBA3O96018 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
APBA3O96018 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
APBA3O96018 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
APBA3O96018 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
APBA3O96018 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
APBA3O96018 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
APBA3O96018 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
APBA3O96018 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
APBA3O96018 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
APBA3O96018 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
APBA3O96018 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
APBA3O96018 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
APBA3O96018 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
APBA3O96018 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
APBA3O96018 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
APBA3O96018 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
APBA3O96018 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
APBA3O96018 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
APBA3O96018 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
APBA3O96018 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
APBA3O96018 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
APBA3O96018 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
APBA3O96018 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
APBA3O96018 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
APBA3O96018 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
APBA3O96018 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
APBA3O96018 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
APBA3O96018 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
APBA3O96018 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
APBA3O96018 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
APBA3O96018 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
APBA3O96018 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
APBA3O96018 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
APBA3O96018 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
APBA3O96018 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
APBA3O96018 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
APBA3O96018 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
APBA3O96018 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
APBA3O96018 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
APBA3O96018 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
APBA3O96018 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
APBA3O96018 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
APBA3O96018 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
APBA3O96018 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
APBA3O96018 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
APBA3O96018 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
APBA3O96018 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
APBA3O96018 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
APBA3O96018 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
APBA3O96018 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
APBA3O96018 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
APBA3O96018 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
APBA3O96018 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
APBA3O96018 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APBA3O96018 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
APBA3O96018 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
APBA3O96018 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
APBA3O96018 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APBA3O96018 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
APBA3O96018 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
APBA3O96018 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
APBA3O96018 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
APBA3O96018 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
APBA3O96018 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
APBA3O96018 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
APBA3O96018 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APBA3O96018 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APBA3O96018 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APBA3O96018 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APBA3O96018 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APBA3O96018 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APBA3O96018 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
APBA3O96018 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
APBA3O96018 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
APBA3O96018 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
APBA3O96018 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
APBA3O96018 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APBA3O96018 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APBA3O96018 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APBA3O96018 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APBA3O96018 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APBA3O96018 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APBA3O96018 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APBA3O96018 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
APBA3O96018 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
APBA3O96018 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
APBA3O96018 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APBA3O96018 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APBA3O96018 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APBA3O96018 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
APBA3O96018 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
APBA3O96018 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
APBA3O96018 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
APBA3O96018 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.57■■■□□ 2
APBA3O96018 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
APBA3O96018 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms