Protein–RNA interactions for Protein: O95935

TBX18, T-box transcription factor TBX18, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX18O95935 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBX18O95935 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBX18O95935 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBX18O95935 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBX18O95935 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBX18O95935 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBX18O95935 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TBX18O95935 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBX18O95935 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBX18O95935 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBX18O95935 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBX18O95935 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBX18O95935 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TBX18O95935 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBX18O95935 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TBX18O95935 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBX18O95935 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBX18O95935 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TBX18O95935 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TBX18O95935 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TBX18O95935 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TBX18O95935 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBX18O95935 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBX18O95935 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBX18O95935 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBX18O95935 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TBX18O95935 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBX18O95935 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TBX18O95935 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBX18O95935 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBX18O95935 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBX18O95935 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBX18O95935 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBX18O95935 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBX18O95935 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TBX18O95935 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBX18O95935 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBX18O95935 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBX18O95935 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBX18O95935 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TBX18O95935 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBX18O95935 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TBX18O95935 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBX18O95935 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBX18O95935 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBX18O95935 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TBX18O95935 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBX18O95935 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBX18O95935 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBX18O95935 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBX18O95935 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBX18O95935 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBX18O95935 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBX18O95935 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBX18O95935 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBX18O95935 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBX18O95935 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBX18O95935 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBX18O95935 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBX18O95935 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBX18O95935 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBX18O95935 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBX18O95935 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBX18O95935 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TBX18O95935 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBX18O95935 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBX18O95935 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBX18O95935 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBX18O95935 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBX18O95935 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBX18O95935 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBX18O95935 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBX18O95935 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBX18O95935 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBX18O95935 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBX18O95935 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBX18O95935 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBX18O95935 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBX18O95935 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBX18O95935 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBX18O95935 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBX18O95935 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBX18O95935 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBX18O95935 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBX18O95935 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBX18O95935 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBX18O95935 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBX18O95935 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TBX18O95935 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBX18O95935 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBX18O95935 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBX18O95935 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBX18O95935 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBX18O95935 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBX18O95935 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBX18O95935 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBX18O95935 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBX18O95935 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBX18O95935 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBX18O95935 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms