Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF4AO95239 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms