Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SIN3BO75182 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIN3BO75182 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms