Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RAB11FIP3O75154 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB11FIP3O75154 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms