Protein–RNA interactions for Protein: O60318

MCM3AP, Germinal-center associated nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3APO60318 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM3APO60318 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM3APO60318 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms