Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC3O43617 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC3O43617 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms