Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBDO15205 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBDO15205 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBDO15205 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBDO15205 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBDO15205 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBDO15205 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBDO15205 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBDO15205 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBDO15205 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBDO15205 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBDO15205 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBDO15205 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBDO15205 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBDO15205 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBDO15205 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBDO15205 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBDO15205 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBDO15205 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBDO15205 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBDO15205 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBDO15205 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBDO15205 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBDO15205 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBDO15205 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBDO15205 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBDO15205 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBDO15205 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBDO15205 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBDO15205 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBDO15205 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBDO15205 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBDO15205 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBDO15205 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBDO15205 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBDO15205 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBDO15205 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBDO15205 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBDO15205 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBDO15205 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBDO15205 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBDO15205 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBDO15205 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBDO15205 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBDO15205 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBDO15205 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
UBDO15205 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBDO15205 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBDO15205 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBDO15205 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBDO15205 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBDO15205 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
UBDO15205 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
UBDO15205 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBDO15205 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
UBDO15205 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBDO15205 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBDO15205 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBDO15205 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBDO15205 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBDO15205 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBDO15205 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBDO15205 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBDO15205 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBDO15205 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBDO15205 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBDO15205 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
UBDO15205 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
UBDO15205 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBDO15205 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBDO15205 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBDO15205 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBDO15205 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBDO15205 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBDO15205 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBDO15205 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBDO15205 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
UBDO15205 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBDO15205 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBDO15205 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBDO15205 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBDO15205 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBDO15205 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBDO15205 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBDO15205 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBDO15205 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBDO15205 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBDO15205 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBDO15205 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBDO15205 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBDO15205 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBDO15205 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBDO15205 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBDO15205 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBDO15205 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBDO15205 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBDO15205 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBDO15205 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBDO15205 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBDO15205 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 465.2 ms