Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PODXLO00592 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PODXLO00592 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PODXLO00592 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PODXLO00592 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PODXLO00592 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PODXLO00592 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PODXLO00592 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PODXLO00592 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PODXLO00592 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PODXLO00592 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PODXLO00592 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PODXLO00592 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PODXLO00592 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PODXLO00592 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PODXLO00592 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PODXLO00592 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PODXLO00592 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PODXLO00592 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PODXLO00592 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PODXLO00592 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PODXLO00592 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PODXLO00592 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PODXLO00592 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PODXLO00592 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PODXLO00592 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PODXLO00592 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PODXLO00592 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PODXLO00592 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PODXLO00592 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PODXLO00592 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PODXLO00592 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PODXLO00592 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PODXLO00592 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PODXLO00592 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PODXLO00592 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PODXLO00592 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PODXLO00592 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PODXLO00592 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PODXLO00592 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PODXLO00592 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PODXLO00592 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PODXLO00592 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PODXLO00592 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PODXLO00592 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PODXLO00592 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PODXLO00592 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PODXLO00592 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PODXLO00592 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PODXLO00592 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PODXLO00592 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PODXLO00592 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PODXLO00592 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PODXLO00592 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PODXLO00592 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PODXLO00592 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PODXLO00592 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PODXLO00592 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PODXLO00592 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PODXLO00592 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PODXLO00592 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PODXLO00592 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PODXLO00592 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PODXLO00592 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PODXLO00592 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PODXLO00592 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PODXLO00592 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PODXLO00592 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PODXLO00592 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PODXLO00592 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PODXLO00592 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PODXLO00592 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PODXLO00592 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PODXLO00592 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PODXLO00592 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PODXLO00592 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PODXLO00592 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PODXLO00592 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PODXLO00592 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PODXLO00592 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PODXLO00592 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PODXLO00592 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PODXLO00592 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PODXLO00592 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PODXLO00592 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PODXLO00592 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PODXLO00592 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PODXLO00592 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PODXLO00592 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PODXLO00592 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PODXLO00592 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PODXLO00592 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PODXLO00592 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PODXLO00592 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PODXLO00592 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PODXLO00592 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PODXLO00592 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PODXLO00592 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PODXLO00592 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PODXLO00592 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms