Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GFRA2O00451 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GFRA2O00451 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GFRA2O00451 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GFRA2O00451 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GFRA2O00451 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GFRA2O00451 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GFRA2O00451 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GFRA2O00451 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GFRA2O00451 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GFRA2O00451 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GFRA2O00451 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GFRA2O00451 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GFRA2O00451 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GFRA2O00451 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GFRA2O00451 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GFRA2O00451 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GFRA2O00451 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GFRA2O00451 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GFRA2O00451 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GFRA2O00451 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GFRA2O00451 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GFRA2O00451 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GFRA2O00451 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GFRA2O00451 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GFRA2O00451 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GFRA2O00451 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GFRA2O00451 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GFRA2O00451 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GFRA2O00451 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GFRA2O00451 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GFRA2O00451 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GFRA2O00451 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GFRA2O00451 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GFRA2O00451 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GFRA2O00451 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GFRA2O00451 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GFRA2O00451 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GFRA2O00451 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms