Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3CDO00329 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms